1) prowadzenie spraw związanych z bezpieczeństwem cyberprzestrzeni Rzeczypospolitej Polskiej, w szczególności związanych z kształtowaniem polityki ochrony cyberprzestrzeni Rzeczypospolitej Polskiej;
2) opracowywanie, wdrażanie i przeglądy dokumentów strategicznych w zakresie spraw związanych z bezpieczeństwem cyberprzestrzeni;
3) inicjowanie badań naukowych lub prac rozwojowych w obszarze cyberbezpieczeństwa;
4) upowszechnianie wiedzy dotyczącej cyberbezpieczeństwa;
5) współpraca międzynarodowa w zakresie cyberbezpieczeństwa;
6) prowadzenie rejestru pełnomocników do spraw bezpieczeństwa cyberprzestrzeni;
7) zapewnienie realizacji zadań Ministra w zakresie obronności państwa, realizowanie przedsięwzięć z zakresu pozamilitarnych przygotowań obronnych Ministerstwa oraz planowanie i koordynowanie realizacji zadań obronnych w Ministerstwie, w urzędach obsługujących organy podległe Ministrowi lub przez niego nadzorowane i w jednostkach podległych Ministrowi lub przez niego nadzorowanych;
8) prowadzenie spraw związanych z realizacją zadań Ministra wynikających z przepisów ustawy o ochronie informacji niejawnych oraz z organizacją i funkcjonowaniem systemu ochrony informacji niejawnych w Ministerstwie;
9) koordynacja i nadzór nad realizacją zadań określonych ustawą o ochronie danych osobowych w zakresie właściwości Ministra;
10) prowadzenie ewidencji upoważnień wydawanych na podstawie ustawy o ochronie informacji niejawnych oraz ustawy o ochronie danych osobowych;
11) prowadzenie spraw dotyczących zarządzania kryzysowego;
12) zapewnienie realizacji obowiązków na rzecz obronności, bezpieczeństwa państwa oraz bezpieczeństwa publicznego w zakresie telekomunikacji;
13) pełnienie funkcji Krajowego Punktu Kontaktowego (PoC), którego zadaniem jest gromadzenie informacji na temat incydentów w skali całego kraju i kontakt z analogicznymi instytucjami w innych krajach członkowskich Unii Europejskiej w celu wymiany informacji na temat transnarodowych incydentów;
14) sprawowanie nadzoru nad bezpieczeństwem teleinformatycznym Ministerstwa;
15) prowadzenie spraw wynikających z art. 6 rozporządzenia Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) Nr 211/2011 z dnia 16 lutego 2011 r. w sprawie inicjatywy obywatelskiej;
16) prowadzenie spraw związanych z nadzorem Ministra nad Naukową i Akademicką Siecią Komputerową.
W strukturze Departamentu funkcjonuje pion ochrony informacji niejawnych, którym kieruje Pełnomocnik do spraw Ochrony Informacji Niejawnych.
